Tujuan dari didirikannya ISS adalah :
- Memasyarakatkan sains dan budaya ilmiah pada masyarakat
- Menciptakan budaya ilmiah dikalangan pelajar, mahasiswa dan akademisi
- Menjadi wadah inovasi dan kreativitas untuk peneliti muda Indonesia
- Menjadi wadah berbagi guru penggerak Indonesia untuk senantiasa menciptakan pola pengajaran yang benar-benar inovatif dan produktif
- Menjadi Lembaga refresentatif dari lembaga pengembangan sains dari pelbagai negara di dunia.